Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD10P28358 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD10P28358 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms