Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HLA-DMAP28067 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms