Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTSSP25774 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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CTSSP25774 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CTSSP25774 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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