Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA6P23229 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms