Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CCNA2P20248 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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CCNA2P20248 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CCNA2P20248 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCNA2P20248 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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