Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NFKB1P19838 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms