Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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