Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBTFP17480 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms