Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ZNF761-205ENST00000613950 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HOXB1P14653 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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