Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms