Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAVP06756 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAVP06756 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms