Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALB1P05937 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CALB1P05937 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CALB1P05937 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms