Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYBBP04839 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms