Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ACSL4O60488 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACSL4O60488 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms