Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALUO43852 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALUO43852 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALUO43852 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALUO43852 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms