Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SGTAO43765 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGTAO43765 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGTAO43765 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SGTAO43765 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGTAO43765 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SGTAO43765 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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