Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRTO14522 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRTO14522 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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