Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
O00370 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
O00370 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
O00370 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms