Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GOLGA8SH3BPF8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GOLGA8SH3BPF8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms