Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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NEDD8-MDP1E9PL57 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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