Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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