Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGB1P1B2RPK0 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms