Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRPF3Q9ULD4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms