Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CGGBP1Q9UFW8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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