Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD93Q9NPY3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms