Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KIAA1549Q9HCM3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KIAA1549Q9HCM3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KIAA1549Q9HCM3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KIAA1549Q9HCM3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KIAA1549Q9HCM3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KIAA1549Q9HCM3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KIAA1549Q9HCM3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
KIAA1549Q9HCM3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KIAA1549Q9HCM3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms