Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ACTR3CQ9C0K3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms