Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BBS2Q9BXC9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms