Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KATNB1Q9BVA0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms