Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VAMP8Q9BV40 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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