Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM175Q9BSA9 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms