Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SPOCK3Q9BQ16 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms