Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms