Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms