Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCG3Q8WXD2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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