Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRN4Q8WUT4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms