Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms