Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms