Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPC24Q8NBT2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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