Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HECW1Q76N89 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms