Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CCDC144NLQ6NUI1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms