Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SUMO4Q6EEV6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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