Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PAPD7Q5XG87 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms