Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HP1BP3Q5SSJ5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HP1BP3Q5SSJ5 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HP1BP3Q5SSJ5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HP1BP3Q5SSJ5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HP1BP3Q5SSJ5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms