Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms