Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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