Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHD9Q3L8U1 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHD9Q3L8U1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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