Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CCDC142Q17RM4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CCDC142Q17RM4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CCDC142Q17RM4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CCDC142Q17RM4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CCDC142Q17RM4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC142Q17RM4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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