Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CLPPQ16740 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms