Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN9AQ15858 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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